origin怎麼做熱圖(origin怎麼畫熱圖)
熱圖作為生物資訊中一種常用的資料表現方法,可以簡單地匯聚大量資料,同時可使用一種相對應的漸變顏色來展示資料。這種方法可以很直觀地呈現空間資料的疏密程度或頻率高低。
常見繪製熱圖的方法有很多,如可用R包,OmicSare tools的熱圖工具,Heml等繪製。那麼如何利用Origin繪製熱圖呢?讓我們來一起學習一下吧~
01
匯入資料
把資料輸入到origin的sheet中;26個英文字母為26行,每一列的名稱以數字1~26命名(資料為隨機輸入)
02
繪製熱圖
①選中全部資料;②點選Plot;③點選Heatmap圖示的▼;④選擇Heatmap with labels(與Heatmap的區別為有無labels,labels可以在後續的設定中更改)
彈出Plotting: plotvm對話方塊,Data Layout 可以根據自己的需要選擇用X軸或Y軸表示,本文選擇Y across columns。其他引數一般預設即可。
示例圖:可以看到選擇Y across columns,則Long name 為Y軸。
03
美化
(1)調整圖形尺寸:雙擊圖形,彈出Plot Details對話方塊,在對話方塊左側選擇Layer 1,點選對話方塊右側Size/Speed按鈕,對圖形的尺寸進行更改;
(2)更改Lables:雙擊圖形,彈出Plot Details對話方塊,在對話方塊左側選擇Sheet 1,點選對話方塊右側Lable按鈕;
- 不勾選Enable,則在熱圖中無Labels。
- 勾選Enable,則顯示labels,並且可以對Labels的字型、字號、旋轉角度以及顏色等特徵進行設定;
(3)更改填充顏色:雙擊圖形,彈出Plot Details對話方塊,在對話方塊左側選擇Sheet 1,點選對話方塊右側Colormap按鈕,點選Fill後彈出對話方塊,以3-Color Limiting Mixing為例,設定中間色為Yellow。點選OK並應用,可以看到如下效果圖:
其他選項大家可以自己挖掘一下!
例如在Load Palette中有很多系統自帶的配色可供選擇。
(4)顏色刻度值和範圍:雙擊圖形,彈出Plot Details對話方塊,在對話方塊左側選擇Sheet 1,點選對話方塊右側Colormap按鈕,點選Level後彈出對話方塊。熱值範圍1~51,Major Levels預設5,為主刻度數。Minor Levels預設5,為中間插入的顏色數量,若改變Minor Levels會使得顏色漸變條更光滑。
比如Minor Levels設定200,Total也會隨之改變。
下圖分別是Minor Levels為5和200的熱圖,可以明顯的看出Minor Levels為200的熱圖顏色漸變條更光滑更自然。
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